MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 34479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018644	TGA	2	6	146667	146672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707192
3502	NC_018644	T	6	6	146682	146687	0 %	100 %	0 %	0 %	406707192
3503	NC_018644	T	6	6	146699	146704	0 %	100 %	0 %	0 %	406707192
3504	NC_018644	AC	3	6	146709	146714	50 %	0 %	0 %	50 %	406707192
3505	NC_018644	CCA	2	6	146755	146760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707192
3506	NC_018644	GAC	2	6	146843	146848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707192
3507	NC_018644	CGA	2	6	146863	146868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707192
3508	NC_018644	TAA	2	6	146889	146894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707192
3509	NC_018644	T	6	6	146899	146904	0 %	100 %	0 %	0 %	406707192
3510	NC_018644	GATA	2	8	146936	146943	50 %	25 %	25 %	0 %	406707192
3511	NC_018644	CAGC	2	8	146975	146982	25 %	0 %	25 %	50 %	406707192
3512	NC_018644	GAT	2	6	147042	147047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707192
3513	NC_018644	TAA	2	6	147418	147423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707193
3514	NC_018644	TC	3	6	147435	147440	0 %	50 %	0 %	50 %	406707193
3515	NC_018644	AT	3	6	147446	147451	50 %	50 %	0 %	0 %	406707193
3516	NC_018644	A	7	7	147490	147496	100 %	0 %	0 %	0 %	406707193
3517	NC_018644	AAG	2	6	147516	147521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707193
3518	NC_018644	TCA	2	6	147617	147622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707193
3519	NC_018644	T	6	6	147659	147664	0 %	100 %	0 %	0 %	406707193
3520	NC_018644	CTT	2	6	147672	147677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707193
3521	NC_018644	AT	3	6	147693	147698	50 %	50 %	0 %	0 %	406707193
3522	NC_018644	CAC	2	6	147702	147707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707193
3523	NC_018644	TGAA	2	8	147781	147788	50 %	25 %	25 %	0 %	406707193
3524	NC_018644	CCA	2	6	147794	147799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707193
3525	NC_018644	GTTT	2	8	147822	147829	0 %	75 %	25 %	0 %	406707193
3526	NC_018644	ATC	2	6	148000	148005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707193
3527	NC_018644	CATT	2	8	148019	148026	25 %	50 %	0 %	25 %	406707193
3528	NC_018644	CTG	2	6	148032	148037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707193
3529	NC_018644	TGG	3	9	148114	148122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707193
3530	NC_018644	GCG	2	6	148124	148129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406707193
3531	NC_018644	TTG	2	6	148168	148173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707193
3532	NC_018644	GA	3	6	148184	148189	50 %	0 %	50 %	0 %	406707193
3533	NC_018644	ATG	2	6	148190	148195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707193
3534	NC_018644	CAC	2	6	148212	148217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707193
3535	NC_018644	ACCA	2	8	148326	148333	50 %	0 %	0 %	50 %	406707193
3536	NC_018644	CAA	2	6	148389	148394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707193
3537	NC_018644	GAT	2	6	148428	148433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707193
3538	NC_018644	GA	3	6	148434	148439	50 %	0 %	50 %	0 %	406707193
3539	NC_018644	CATT	2	8	148496	148503	25 %	50 %	0 %	25 %	406707193
3540	NC_018644	CTT	2	6	148668	148673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707193
3541	NC_018644	TGA	2	6	148674	148679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707193
3542	NC_018644	ATA	2	6	148701	148706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707193
3543	NC_018644	ACCGC	2	10	148781	148790	20 %	0 %	20 %	60 %	406707193
3544	NC_018644	TCA	2	6	148833	148838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707193
3545	NC_018644	ATGA	2	8	148945	148952	50 %	25 %	25 %	0 %	406707193
3546	NC_018644	GCTC	2	8	148982	148989	0 %	25 %	25 %	50 %	406707193
3547	NC_018644	A	6	6	148991	148996	100 %	0 %	0 %	0 %	406707193
3548	NC_018644	T	6	6	149097	149102	0 %	100 %	0 %	0 %	406707194
3549	NC_018644	ATA	2	6	149209	149214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707194
3550	NC_018644	GAT	2	6	149243	149248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707194
3551	NC_018644	TTA	2	6	149261	149266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707194
3552	NC_018644	TAA	2	6	149316	149321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707194
3553	NC_018644	AGA	2	6	149389	149394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707194
3554	NC_018644	AAT	2	6	149432	149437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707194
3555	NC_018644	CTCC	2	8	149532	149539	0 %	25 %	0 %	75 %	406707194
3556	NC_018644	GAT	2	6	149562	149567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707194
3557	NC_018644	CGAT	2	8	149571	149578	25 %	25 %	25 %	25 %	406707194
3558	NC_018644	CAT	2	6	149581	149586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707194
3559	NC_018644	CGA	2	6	149587	149592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707194
3560	NC_018644	T	6	6	149607	149612	0 %	100 %	0 %	0 %	406707194
3561	NC_018644	CAG	2	6	149676	149681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707194
3562	NC_018644	TTG	2	6	149728	149733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707194
3563	NC_018644	ATC	2	6	149737	149742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707194
3564	NC_018644	TGT	2	6	149750	149755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707194
3565	NC_018644	T	6	6	149769	149774	0 %	100 %	0 %	0 %	406707194
3566	NC_018644	AG	3	6	149776	149781	50 %	0 %	50 %	0 %	406707194
3567	NC_018644	TAC	2	6	149818	149823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707194
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3569	NC_018644	AAT	2	6	149856	149861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707194
3570	NC_018644	CTT	2	6	149895	149900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707195
3571	NC_018644	GATC	2	8	149936	149943	25 %	25 %	25 %	25 %	406707195
3572	NC_018644	TCAC	2	8	149966	149973	25 %	25 %	0 %	50 %	406707195
3573	NC_018644	T	6	6	150044	150049	0 %	100 %	0 %	0 %	406707195
3574	NC_018644	GCA	2	6	150104	150109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707195
3575	NC_018644	TCA	2	6	150123	150128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707195
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3579	NC_018644	GGA	2	6	150479	150484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707196
3580	NC_018644	AAT	2	6	150500	150505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707196
3581	NC_018644	A	6	6	150548	150553	100 %	0 %	0 %	0 %	406707196
3582	NC_018644	ATT	2	6	150563	150568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
3583	NC_018644	TGA	2	6	150598	150603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
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3585	NC_018644	A	8	8	150664	150671	100 %	0 %	0 %	0 %	406707196
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3588	NC_018644	GAA	2	6	150698	150703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707196
3589	NC_018644	ATT	2	6	150708	150713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
3590	NC_018644	CTC	2	6	150714	150719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707196
3591	NC_018644	TTC	2	6	150800	150805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
3592	NC_018644	CAAGA	2	10	150883	150892	60 %	0 %	20 %	20 %	406707196
3593	NC_018644	GGT	2	6	150947	150952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707196
3594	NC_018644	GTG	2	6	150990	150995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707196
3595	NC_018644	TC	3	6	151038	151043	0 %	50 %	0 %	50 %	406707196
3596	NC_018644	GAT	2	6	151076	151081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
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3598	NC_018644	CTA	2	6	151113	151118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707196
3599	NC_018644	TTC	2	6	151161	151166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
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3601	NC_018644	AG	3	6	151196	151201	50 %	0 %	50 %	0 %	406707196
3602	NC_018644	TTC	2	6	151221	151226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
3603	NC_018644	TGA	2	6	151234	151239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
3604	NC_018644	ATC	2	6	151307	151312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707196
3605	NC_018644	CGT	2	6	151360	151365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707196
3606	NC_018644	AGA	2	6	151492	151497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707196
3607	NC_018644	ATT	2	6	151501	151506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707196
3608	NC_018644	GCGA	2	8	151693	151700	25 %	0 %	50 %	25 %	406707196
3609	NC_018644	TGA	2	6	151753	151758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
3610	NC_018644	GAC	2	6	151887	151892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707197
3611	NC_018644	ATA	2	6	151918	151923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707197
3612	NC_018644	ATA	3	9	152018	152026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707197
3613	NC_018644	AAC	2	6	152187	152192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707198
3614	NC_018644	AGG	2	6	152290	152295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707198
3615	NC_018644	TTTG	2	8	152324	152331	0 %	75 %	25 %	0 %	406707198
3616	NC_018644	TTA	2	6	152348	152353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707198
3617	NC_018644	ACCA	2	8	152368	152375	50 %	0 %	0 %	50 %	406707198
3618	NC_018644	GAG	2	6	152420	152425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707198
3619	NC_018644	TCA	2	6	152465	152470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707198
3620	NC_018644	CCA	2	6	152481	152486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707198
3621	NC_018644	GGCCT	2	10	152656	152665	0 %	20 %	40 %	40 %	406707198
3622	NC_018644	CTT	2	6	152700	152705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707198
3623	NC_018644	TCT	2	6	152736	152741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707198
3624	NC_018644	GCT	2	6	152786	152791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707198
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3992	NC_018644	CT	3	6	171408	171413	0 %	50 %	0 %	50 %	406707217
3993	NC_018644	CTG	2	6	171436	171441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707217
3994	NC_018644	TA	3	6	171475	171480	50 %	50 %	0 %	0 %	406707217
3995	NC_018644	A	6	6	171491	171496	100 %	0 %	0 %	0 %	406707217
3996	NC_018644	TCT	2	6	171498	171503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707217
3997	NC_018644	A	6	6	171541	171546	100 %	0 %	0 %	0 %	406707217
3998	NC_018644	TGC	2	6	171611	171616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707217
3999	NC_018644	TGCA	2	8	171624	171631	25 %	25 %	25 %	25 %	406707217
4000	NC_018644	ATC	2	6	171648	171653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707217

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